女性肛周脓肿有可能会引起妇科疾病。
女性肛门距离阴道比较近，而且直肠和阴道之间只有一层比较薄的组织，称为直肠阴道隔。当直肠前位出现黏膜下脓肿，脓肿如果向阴道内破溃时就有可能会引发直肠阴道瘘，会导致阴道内反复出现感染，需要通过手术才能完全治愈。而且肛周脓肿如果经肛门周围皮肤破溃，脓液就会污染肛周以及会阴部，也有可能会导致患者出现相应的妇科疾病，例如阴道炎等。
所以女性肛周脓肿患者需要特别注意自身肛门，以及会阴区域的清洁卫生。