舌头根部长小疙瘩，可能的原因有以下几种：
1.正常的轮廓乳头表现。在舌根部有轮廓乳头存在，正常人群既可以表现为舌根部有小疙瘩。当有舌乳头炎时或进食辛辣、刺激的食物，就会造成舌乳头发红，轮廓乳头会比较明显。
2.舌头根部长小的疙瘩，也有可能是感冒等造成淋巴滤泡增生，主要是机体抵抗力下降，合并病毒感染导致。
3.舌头根部长小疙瘩，还有可能是发生在舌根部的肿瘤，比如乳头状瘤或其他性质的肿瘤，需要切除送病理检查，以明确诊断。