对于患有食管囊肿的患者，不建议进行按摩，尤其是囊肿比较大的患者，盲目地进行按摩有可能会导致囊肿增大，或者是导致囊肿内有出血现象，或者是出现周围囊肿粘连现象。因此，对于患有食管囊肿的患者，不建议进行按摩。
对于食管囊肿比较小的患者，在日常生活当中也不需要进行特殊处理，但需要定期进行内镜复查囊肿大小。对于比较大的食管囊肿，或者是患者有明显症状出现时，可以进行手术摘除。
绝大多数的食管囊肿属于一种良性病变，在进行治疗时需要根据囊肿大小、患者所出现症状等选择治疗方法。