外阴长好多小水疱，首先考虑有可能是生殖器疱疹。生殖器疱疹发生的原因是感染二型疱疹病毒，这种类型的疱疹病毒对皮肤黏膜和神经都有一定的亲和力。病毒从破损部位的皮肤黏膜入侵以后，可以在感染局部的皮肤黏膜形成水疱。
经过治疗以后症状可以消失，但是病毒仍然可以在神经内长期潜伏，在免疫力低下的情况下，沿神经分布的病毒再次大量复制，出现水疱，引起感染症状。并且生殖器疱疹在患病第1年内有可能反复复发，所以外阴长水疱，建议到正规医院去就诊。