ct检查虽然广泛，但是临床上以颅脑和腹部实质性脏器的ct检查应用为广，并不是全身各系统各部位所有的疾病，都适宜用ct检查。
头部的ct可以检查出脑出血、脑梗塞、脑萎缩和脑部的发育异常。颈椎ct成像可以检查出颈椎椎间盘的突出、颈椎退行性改变，也可以观察甲状腺有无肿瘤、喉癌或者甲状腺的增大。颌面部扫描，可以观察鼻腔、鼻窦和眼睛的病变。
胸部CT可以观察有无肺炎、胸水、胸廓畸形、纵隔的肿瘤、心脏的增大、心包积液、肺部的站位等等。
腹部ct可以检查肝、胆、胰、脾、肾、肾上腺、子宫附件及前列腺、膀胱等病变。双下肢可以检查有无发育畸形、骨肿瘤、软组织肿瘤。血管成像可以观察有无血管的梗阻、栓塞。全身大部分疾病均可以做ct检查，但是临床一定要把握好指征。