肛裂的主要危害在于引起的疼痛感和愈合以后形成的疤痕组织。肛裂的形成原因主要是由于长期腹泻或者是便秘，造成肛门皮肤的破损，破损时会形成剧烈疼痛，呈周期性发作，影响患者的正常生活和工作。
患者可能会由于惧怕疼痛而不排便，当伤口愈合时会形成一个疤痕组织，反复的肛裂会引起斑痕挛缩，造成肛门狭窄，使大便难以排出，需要手术治疗，去除疤痕组织松解括约肌。
肛裂会有少量的出血，还有可能会引起局部感染，因此应当积极治疗。