肛裂的手术时间与肛裂的严重程度，以及手术医师的熟练程度有关，一般30分钟左右。
目前临床上对于肛裂的治疗方案分为，在病情早期多采用扩肛术，属于简便易行的有创操作，就是扩肛每周2-3次，每次持续时间依据患者的耐受情况而定，一般在5-10分钟左右。对于早期患者，其效果一般，复发率高。
对于慢性肛裂，一般采取后方或者侧方括约肌切开术，或者肛裂切除术。这种手术时间较长，要求手术医师有丰富的手术经验，一般手术时间是60分钟左右。