慢性肾炎不会引起囊肿的发生。虽然慢性肾炎的患者可能会合并有囊肿，但囊肿与慢性肾炎之间没有关系。慢性肾炎是一种免疫功能出现紊乱性的疾病，发生病变的主要部位是在肾小球，也就是表现为肾小球系膜细胞增生、基底膜增厚，甚至会出现肾小球的硬化。
关于囊肿的发生机制虽然还没有完全清楚，但是目前考虑有些囊肿的发生是与遗传因素有关系，比如多囊肾。有些囊肿的发生考虑是与肾小管憩室增加有关系。当慢性肾炎合并有囊肿以后，主要是针对慢性肾炎进行治疗，囊肿并不需要做特殊的处理。
所以，当患者出现慢性肾炎，一定要引起重视。