打完退烧针之后仍然高烧39℃，这时需要注意退烧针的注射时间。如果时间比较短，在半小时至1小时之间，不必急于应用药物治疗。这种情况考虑与退烧针还没有完全发挥作用有关，可以通过多喝温水，配合物理降温的方式，促进体温下降。
如果体温一直难以恢复，则需要应用解热镇痛的药物治疗，比如对乙酰氨基酚或者布洛芬。另外，为了避免持续高烧，还要尽快查明病因，如果是病毒感染所致，打完退烧针之后仍然高烧39℃，这时还需要搭配抗病毒药物治疗，比如阿昔洛韦、利巴韦林、奥司他韦等。
如果与细菌感染有关，需要尽快应用青霉素类、头孢类抗菌药物治疗，才能更好地促进体温下降。