精子染色体异常是可能会引起自然流产的。一般自然流产多与父母因素以及环境因素有关，胚胎或者胎儿的染色体异常一般都会可都可能会出现流产的症状，并且如果母体中受到感染、有疾病等，也会导致自然流产的现象。
因此父亲的精子的染色体异常，是会导致自然流产，还可能会导致胎儿停止发育以及发育畸形的症状，建议最好要去医院进行相应的检查，并根据医生的建议对症治疗。
在备孕期间，应注意自己的环境安全，并且要加强锻炼，做好相关方面的检查，为胎儿创造一个良好的环境，尽量避免出现自然流产以及胎儿畸形的风险，并且怀孕后及时做产前检查及大排畸筛查。