黄水疮留下的瘢痕可以尽早给予一些软化瘢痕的药物治疗，必要时需要结合手术的方法治疗。
黄水疮也称之为脓疱疮，这是一种化脓性感染性皮肤疾病，由于感染会损伤到皮肤的真皮甚至皮下组织，所以在黄水疮愈合后也容易遗留瘢痕。治疗脓疱疮愈合后留下来的瘢痕，早期可以使用一些具有抑制瘢痕形成以及软化瘢痕的药物治疗，譬如使用多磺酸粘多糖乳膏外擦。
药物越早使用效果越好，到了后期药物很难达到预期的治疗效果，可以通过手术的方法治疗，其中就包括激光治疗和皮肤消磨术治疗。