子宫内膜增厚有不同的原因。最常见的是生理性的子宫内膜增厚。
一般来说，在月经刚刚结束的时候，子宫内膜已经经过月经完全脱落，此时子宫内膜较薄。随着卵巢分泌的雌激素水平增加，子宫内膜逐渐增厚。
到月经来潮之前，子宫内膜可以达到1厘米以上，这种子宫内膜增厚是生理性子宫内膜增厚，不影响怀孕。有些情况是异常的子宫内膜增厚，如子宫内膜息肉，超声下子宫内膜不均匀增厚。有可能由于子宫膜炎子宫内膜增生症，甚至是子宫内膜癌导致的子宫内膜增厚。这种情况，由于受精卵不能着床，会影响受孕，而子宫内膜癌是需要积极的进一步治疗的。