甲型流感病毒阴性一般并不严重，但具体需要根据患者的实际情况判断。
在临床医学上，出现流感样症状，在做甲型H1N1流感病毒核酸检测时，若是结果呈现阳性，通常可诊断为甲型流感。而目前结果呈现阴性，表明在检测样本时并没有检测到这种病毒，也意味着患者并没有感染上这种病毒。
需要注意，也不排除检查结果是假阴性，想判断是否得了甲型流感，可做其他检查再次诊断。比如若是分离到甲型H1N1流感病毒，通常也能作为诊断标准，表明感染上了甲型流感。