巧克力囊肿是子宫内膜异位到卵巢上，在卵巢的皮质内生长而引起的，具有活性的子宫内膜在卵巢内周期性的生长，形成单个或者多个的囊肿。
子宫内膜在囊肿内出血，陈旧性血液聚集在囊内，就形成咖啡色粘稠液体，就像巧克力一样，所以就叫巧克力囊肿，实际上是卵巢子宫内膜异位囊肿。
巧克力囊肿容易引起月经不调、盆腔粘连，会引起痛经，会影响卵巢的功能，会影响排卵，导致不孕，严重的影响女性的身体健康。
要预防巧克力囊肿，一定要注意不要在经期同房，经期不要剧烈运动，要减少人工流产次数以及其他的一些宫腔操作。