肛门流黄水有腥臭味，首先到医院进行检查，在找到原因以后及时地进行对因、对症的治疗。
肛门流黄水有腥臭味，首先考虑有痔疮的存在，痔疮当中的内痔如果发生了脱出可以使肠液外溢出现肛门流黄水有腥臭味的表现。如果有外痔存在也可以导致肛门口的闭合不严出现肠液的外溢，形成肛门流黄水有腥臭味的症状。
另外，排除是不是有肛门周围脓肿，有肛瘘的存在是属于感染化脓性的疾病，肛周脓肿和肛瘘会出现脓性的分泌物，可以表现为肛门流黄水有腥臭味的情况，建议患者早到医院进行检查。
如果是由于痔疮的因素可以先进行药物治疗，如果是由于脓肿的因素需要手术治疗。