HIV感染后的病程分为急性感染期、无症状感染期、艾滋病前期和艾滋期。在急性期，约50-70%的感染者，在感染2到4周以后出现类似感冒或者单核细胞增多症的表现，包括发热、咽炎、头痛、关节痛以及全身乏力等。
体格检查时可以发现颈部及腋下淋巴结肿大，躯干部以上皮肤出现荨麻疹样或者血管炎样皮损，以及恶心、呕吐、腹泻等胃肠道症状，还可以看到黏膜溃疡。
此时HIV抗体是阴性的，但血中可以查到hiv的DNA或者RNA，和P24抗原。在出现症状后2到4周，机体HIV抗体逐渐转阳，从感染到血清转阳的这段时间就称为“窗口期”，一般为4到8周，窗口期检测hiv抗体是阴性的。