川连和黄连都是中药的称呼，而川连又是黄连的一种，所以黄连比川连的范围更广些。
川连是黄连的道地药材，道地药材的质量要优于其他产地的药材。两者是可以替换的，是同一味中药材，但是川连的质量更好。
黄连的主要功效有泻火解毒、清热燥湿、明目、杀虫止痒等，临床上多用于治疗湿热痞满、呕吐吞酸、腹泻、黄疸、高热神昏、心烦难寐、目赤牙痛、湿疹湿疮、耳道流脓等。黄连的入药部位是黄连植株的根茎，其味道虽极苦，却是一味药用价值比较高的中药。