自身免疫性肝病的检查，主要分为无创检查以及有创检查两部分，在临床上以无创检查为主，其主要包括影像学检查以及抽血检查。
在影像学检查方面，一般以肝脏B超或肝脏CT为主，主要判断肝脏形态改变。抽血检查方面主要包括炎性指标检查、肝功能检查以及自身免疫相关性指标检查，以判断患者是否合并免疫相关性病变。
如无创性检查不能明确诊断，需要进一步进行肝脏穿刺检查，此操作可取出一部分肝组织，通过病理检查方式协助诊断。