医院源性胆管损伤是指腹部手术时，因手术意外造成的胆管损伤，其主要原因有解剖结构变异，手术当中因为黏连、侵袭或手术操作不当等造成。所以在手术的过程当中，一旦发现有组织变异情况发生，应该详细的给予鉴别，待完全确定组织器官后，再实行手术。
如果出现损伤的情况，一般视情况决定下一步治疗方法，损伤较轻的多数可自行愈合。如果不能愈合或损伤较重的应及时给于手术，中医治疗多数情况，只能起到辅助的效果，其主要是利肝、利胆的治疗。