神经元损害应针对病因对症治疗。
首先，当婴幼儿发生脑瘫的时候会导致神经元损害，建议患者主要以现代康复为主，早期康复治疗可改善患者的智能和运动功能。
其次，当发生脑血管病的时候也会出现神经元的损害，这时应针对病因系统地治疗。如果是脑出血引起，主要以调整血压、营养脑神经、减轻脑水肿和降低颅内压为主。如果是脑梗引起，主要以溶栓治疗或改善循环、活血化瘀、抗血小板聚集和对症治疗为主。
如果发生神经元的损害之后不可逆，只能通过康复训练代偿部分神经元功能。