患者早上起床时尿液颜色发黄，多数是正常的生理现象。因为患者夜间处于睡眠状态，肾脏的血流量会相对减少，导致原尿生成减少。而且肾小管对水的重吸收会增加，导致尿液浓缩，这是导致患者晨尿颜色发黄的原因之一。
另外，夜间尿液在膀胱内存储的时间较长，也是导致晨尿颜色发黄的原因，不需要予以特殊治疗，会逐渐恢复正常。
但也可能是由于尿路感染等病理性疾病引起，这种情况下患者常伴有尿频、尿急、尿痛等尿路刺激症状，且尿常规检查可见细菌及白细胞计数升高。这时患者需要积极抗炎治疗，并增加饮水量。