从目前临床上来说，试管婴儿的畸形率并不是明显的高于正常妊娠的婴儿，说明试管婴儿从畸形这个方面来讲，和正常怀孕的婴儿发生畸形的概率是一样的。
但是另外方面有表明，认知障碍可能会比正常的婴儿要高一些，危险率会增加一倍。认知障碍不属于畸形方面的问题，它是属于精神方面的问题，孩子出生以后不会出现缺胳膊少腿的情况，外观来说都是很正常的，但是随着不断的长大，容易出现一些注意缺陷方面的问题，比如阅读障碍、注意力不是很集中、做事不是很专心等，但是这个认知障碍具体与试管婴儿技术有没有关系，还不是特别的肯定。