精囊炎和前列腺炎主要从症状、体征、实验室检查、辅助检查上来区分，两种疾病在症状上看没有明显的区别，主要表现会阴部疼痛，有时可以放射至腹股沟区等。
在查体方面，精囊炎可以导致下腹部压痛，前列腺炎的患者行肛门指诊时可以出现前列腺的压痛。
在实验室检查方面，两者尿液中都有可能有白细胞，也可以发现精液中混有细菌，肛诊取前列腺液检查如有细菌可以确诊前列腺炎。
影像学检查两者有明显区别，精囊炎表现为精囊饱满，其内部可能会有结石、边缘模糊不清等。
治疗上两者没有本质的区别，一般通过物理治疗，效果是不错的。