真菌性角膜炎的诊断，可以通过病史、症状、裂隙灯检查等，进行诊断。
真菌性角膜炎一般发生在角膜外伤后，角膜的伤口感染了真菌。真菌经过一段时间的繁殖后，就会导致患者发生真菌性角膜炎，且真菌性角膜炎一般发生于脓液活动所导致的角膜外伤后。
因此，如果患者有脓液活动的眼部外伤史，且发生视力下降、角膜溃疡，应该怀疑是真菌性角膜炎。此时应当进行裂隙灯检查，观察角膜形态。如果角膜上有真菌的菌丝、伪足，或者真菌浸润灶，一般就可以确诊。必要时，可以进行微生物培养或者角膜表面涂片检查。