宝宝肛周脓肿可以服用抗生素，外用清热解毒的中药治疗。
宝宝发生肛周脓肿，通常是肛周皮下受到细菌感染引发的，属于一种急性化脓性疾病。刚开始形成时可以应用药物治疗缓解症状，可以口服抗生素，如头孢克洛、阿莫西林颗粒等。比较严重的也可以通过静脉点滴头孢呋辛、头孢曲松等药物，肿物局部可以涂抹莫匹罗星软膏消炎止痛。
用清热解毒的中药、高锰酸钾溶液坐浴，改善局部的疼痛。但如果已经形成明显的脓肿，有波动感，伴有发烧，需要尽快手术切开引流，再抗感染治疗，避免形成肛瘘。