窦性心律不齐并不会导致心肌梗塞，在临床上绝大多数的窦性心律不齐是属于生理性的，并不属于异常的情况。窦性心律不齐的人并不会引起心输出量的下降，也不会引起冠状动脉灌注压的下降。
在临床上引起心肌梗塞的原因，主要是因为冠状动脉粥样硬化斑块的不稳定，导致局部形成血栓，使血管急性闭塞，造成心肌持续性的缺血、缺氧，引起心肌的坏死。此外持续性的冠状动脉痉挛以及冠状动脉灌注压明显下降，也会引起心肌梗死。
而窦性心律不齐一般不会导致上述的情况出现，因此也不会引起心肌梗塞的发生，而且窦性心律不齐也不要给予特殊的处理。