尿道流黄脓可能是淋病，也可能为非淋菌性尿道炎。淋病与非淋菌性尿道炎的区别是致病菌不同，淋病通常为淋球菌感染所引起，淋球菌是一种比较常见的化脓性细菌，会附着在尿道黏膜。
非淋菌性尿道炎的致病菌，通常为支原体、衣原体等。要想完全确诊是哪种类型的致病菌，应提取龟头局部的分泌物进行涂片培养，确定致病菌的类型后，还应做进一步的药敏试验，选用敏感抗生素类药物进行治疗，治疗效果才最佳。
在治疗期间，患者一定要做好防传染处理，防止将致病菌传染给配偶。