头痛伴意识模糊考虑脑炎、脑部肿瘤、脑出血、脑梗死、蛛网膜下腔出血、硬膜下出血。通常脑炎有感染先驱症状，表现为头痛、恶心、呕吐、视物模糊等颅内压增高表现，严重时意识模糊，脑脊液检查异常。
通过头颅CT或头颅核磁共振，可以鉴别脑出血、脑梗死、脑部肿瘤。蛛网膜下腔出血主要依据腰穿鉴别，硬膜下出血通常脑外伤两天至两个月后出现头痛。
因为头痛伴意识模糊相对病情较重，如果患者出现上述症状时，应及时送至医院，完善相关检查，明确诊断并予以相应治疗。