孩子在患有鹅口疮的情况下是不建议进行疫苗接种的，因为鹅口疮主要是由念珠菌感染而引起，而真菌感染则常与免疫力低下有关，如果在这种状态下打疫苗，很容易增加疫苗过敏的发生率。
因此，建议先对鹅口疮进行治疗，其治疗方式一般以抗真菌药物为主。对于不存在严重感染的患儿，不建议应用抗生素药物，以免对孩子免疫系统造成损害。
另外，期间应同时做好日常护理，每次喂奶后可适当给宝宝喝温开水，以起到漱口的目的。孩子日常接触的餐具、奶瓶、玩具等，需要定期消毒，以降低病菌对孩子的侵害。