甲状腺囊实性结节有可能会发生癌变。
对于甲状腺发生的结节都存在癌变的可能性，因此对于甲状腺发生的结节，应该定期进行随访检查，及时发现结节的癌变。如果发生短期内的快速增长，或者结节的形态变得不规则，或者结节内有丰富的血流，边界变得不清晰等改变，则考虑癌变可能。应该及早做结节穿刺活检，明确性质。
囊实性甲状腺结节有癌变可能，也有可能合并感染，出现短期内体积变大，局部红肿、疼痛等临床症状。当出现这些表现时，应该首先做血常规、C-反应蛋白等检查，先给予抗生素治疗，治疗后效果不好的建议及早做活检。