淋球菌感染和普通的尿路感染的区别在于感染的细菌种类以及临床症状上。
淋球菌感染主要是革兰氏阴性双球菌感染。而普通的尿路感染除了淋球菌感染以外，还包括支原体、衣原体感染形成的非淋菌性尿道炎以及其他的一些杂菌形成的普通的细菌性尿道炎。
从临床症状角度考虑，淋球菌感染之后会导致排尿出现强烈的疼痛，尿道口会产生明显的黄色的脓液，个别人会呈现绿色的脓液，脓液量大。而普通的尿路感染或者是支原体、衣原体形成的尿路感染，产生的分泌物并不会非常多。主要以一些稀薄的浆液性分泌物为主，而且局部产生的疼痛感觉也并不会非常强烈。
淋球菌感染一般建议选择使用头孢类的药物来进行治疗，而其他类别的尿路感染则需要做病原体的培养加药敏试验，然后针对性进行治疗。