一般引起胃窦癌的病因有很多种，首先在近两年研究比较多的是幽门螺杆菌感染和胃癌的关系，在研究中发现，胃癌的发病率与当地幽门螺杆菌感染率是呈正相关的关系。伴有幽门螺杆菌感染，可使胃黏膜产生急性或者慢性的炎症，从而导致黏膜上皮的损伤细胞增殖、增加。
此外，如果饮食中经常摄入含有亚硝胺类化合物的食物，也会增加患有胃窦癌的风险，多环芳烃类化合物也是强烈地导致胃窦癌发生的因子之一，比如存在于烟草中的3，4-苯并芘，可以导致肺癌的发生率增加。
而由于人在吸烟的时候，可以将部分烟雾吸入到胃内，所以吸烟的人患有胃癌的风险比不吸烟的人也会明显地增加，某些遗传因素的影响在胃窦癌发生过程中同样具有重要的作用。