肾囊肿在病情早期时一般不会有特征性临床表现，一旦出现隐隐作痛的临床症状时，首先需要及时前往医院就诊完善肾脏彩超，明确囊肿的大小以及是否有压迫症状。
如果肾脏囊肿比较小的情况下，可以进行保守治疗，可以服用药物缓解腰部的疼痛。常用的药物有非甾体类止痛药物，例如布洛芬缓释胶囊、双氯芬酸钠栓等。但是在保守治疗的期间，仍然需要定期完善相关检查进行复诊，以便及时发现病情变化，及时就诊。
如果囊肿有大于5cm的情况下，需要进行治疗的，可以进行囊液抽吸术。如果是更大的情况下，还可以进行腹腔镜的手术治疗。