结核性脊髓炎可能伴有后遗症，主要涉及运动功能、感觉功能和自主神经功能。
第一，运动功能障碍。结核性脊髓炎发病后，早期如果能够得到及时治疗有可能会恢复；如果病情进展会损伤脊髓功能引起功能障碍，表现为肢体不完全性截瘫。
第二，感觉功能障碍。如果结核性脊髓炎损伤了脊髓后索或侧索会引起深感觉功能障碍，患者会伴有感觉性的共济失调。
第三，自主神经功能障碍。结核性脊髓炎如果不及时治疗，可能会反复发作，从而损伤括约肌引起二便功能障碍。