慢性睾丸炎会导致睾丸萎缩。睾丸炎分为急性和慢性，在急性期如果积极地治疗，不会有严重的并发症。
如果是慢性睾丸炎，会引起很多并发症，比如睾丸会出现持续性的隐痛，随着病情的加重导致睾丸萎缩。睾丸萎缩后，其产生精子的能力下降，导致男性不育，所以对于慢性睾丸炎，要及时查明病因。
对于不能明确致病菌的慢性睾丸炎，可以行睾丸穿刺活检，然后做细菌培养以及药敏实验，根据结果来调整抗生素的种类，只有这样才能防止睾丸发生萎缩等严重并发症的出现。