小儿肠炎首先应该明确感染的病原菌，然后再选择消炎药物治疗。
如果确诊是细菌感染导致的肠炎，可以在医生的指导下服用头孢克肟颗粒等头孢激素类消炎药物治疗。但是小儿不可以使用氨基糖苷类的抗生素，否则有可能会引起患儿出现耳毒性副作用，也可以选择阿莫西林颗粒等抗生素来进行消炎治疗。
但是，如果小儿肠炎是由于病毒感染所导致的，这种情况是不建议吃消炎药物治疗的，否则会导致肠道内菌群失调，有可能会引起孩子出现病情加重的现象。