1.尿路阿米巴病：首选甲硝唑药物治疗。 如果出现肾阿米巴脓肿或者是肾周阿米巴脓肿，视病情发展决定是否需要切开引流。
2.肾棘球蚴病：首选的抗包虫病的药物为阿苯达唑、甲苯达唑。大多数的治疗方式以手术治疗为主，通过手术切除肾包虫囊肿。
3.滴虫性尿路感染：首选甲硝唑、替硝唑抗感染治疗。此病通常伴随细菌性尿路感染，需要联合抗生素进行治疗。有性伴侣的，应同时进行治疗，治疗期间禁止性生活。
4.尿路丝虫病：目前大多采用乙胺嗪、卡巴胂治疗，但是针对微丝蚴，应用左旋咪唑效果更好。