感觉龟头里面疼痛，其常见的原因是局部摩擦导致损伤性疼痛，常发生于性行为后，由于性体位不当、性动作力度过大、内裤过紧挤压导致损伤性疼痛。导致龟头里面疼痛的另一常见原因是龟头局部感染，由于感染后的炎性刺激而发生疼痛。泌尿道结石下移至龟头舟状窝，也可导致龟头部位疼痛。
为了明确龟头疼痛的病因，需要辅助尿液常规化验，以及局部浅表探头超声检查。损伤、感染引起的疼痛，可对症给予止痛以及抗炎药物治疗。明确结石导致的龟头部位疼痛，可利用专业器械经尿道口取石。