念珠菌感染临床上常用的药物硝呋太尔以及制霉菌素，这两种药物任选其一可以口服用，也可以阴道内使用，因此一旦发生念珠菌感染，最好到医院正规就诊，医务人员会给予最合适的药物口服或者是外用。
妇科最常见的念珠菌感染就是念珠菌性阴道炎容易发生在月经前后，因为这个时间段内体内激素水平发生变化，导致阴道内环境发生变化，尤其以酸性变化为主，这种情况下就会滋生念珠菌。
一旦明确诊断为念珠菌感染，大部分会采用阴道内用药，如果阴道内白带分泌物特别多，可以先进行阴道清洗之后，再给予阴道内用药，治疗念珠菌性阴道炎。