腮腺腺样囊性癌的具体发病原因不详，可能与多种有害因素有关。根据临床研究资料分析，腺样囊性癌的发生可能和口腔黏膜具体细胞变异有关。
有些患者可能有不良的生活习惯，比如长期进食有刺激性的食物，可能会对口腔黏膜的细胞造成刺激，导致细胞发生突变。有些患者的生活环境中可能长期接触有毒物质，有毒物质也会对口腔黏膜造成影响，导致癌变。有些人可能和口腔内的病毒感染有关。
腺样囊性癌既可以侵犯腮腺也可以侵犯腭腺，如能积极治疗大多数患者预后相对较好。