跑步后出现头痛，绝大部分是由于生理性因素引起，通过适当休息后一般会逐渐地好转。
人体在进行大运动量的活动之后，血液流速加快、血管扩张，这时会出现头痛的症状。其次，人体在进行大运动量活动的时候，会导致全身的耗氧量增加，有可能会同时伴有脑血管痉挛，这时会有头晕、头痛的症状。以上两种情况，不需要特殊的治疗，适当地休息后症状会消失。
如果跑步后头痛持续时间较长，而且伴有颅神经受损、肢体运动功能障碍的，应考虑是高血压脑出血所导致的，应及时到医院就诊。