小儿真菌性肠炎主要是由白色念珠菌引起，白色念珠菌是肠道正常菌群之一。长期使用广谱抗生素或肾上腺皮质激素，真菌可大量繁殖引起肠炎。
本病可急可缓，大便次数增加，为黄色稀水便。泡沫多，有黏液，有发霉气味，有的像豆腐渣样，严重的可为脓便或脓血便。患儿可有低热、呕吐、腹胀以及腹痛。
一般治疗方法给予易消化、高热量、高维生素、低脂肪饮食。限制进食牛奶以防腹胀，避免刺激性、多渣食物。可用物理降温，停用原有抗生素，忌用止泻药，可应用微生态制剂。