肺脓肿不治疗有可能会转变为癌症。如果肺脓肿患者及时的接受治疗，肺脓肿一般是不会转变为癌症的。
肺脓肿的存在，会对肺部造成损害，有可能会导致肺部发生部分组织坏死，也会降低肺部的免疫功能，肺部更容易发生病变导致癌症。为了防止肺脓肿转变为癌症，肺脓肿患者要及时的接受治疗，主要通过抗感染和痰液引流的方法治疗。
抗感染药物的选择，可根据痰液和血液的病原体检查的结果进行选择，常用的有青霉素类药物以及大环内酯类药物。痰液引流可以口服祛痰药，也可以使用雾化吸入的方法，帮助痰液排出。