对于肾功能异常的治疗需要明确病因，针对病因进行治疗。如果是急性因素导致的，比如肾血容量灌注不足，需要及时补血、补液。梗阻因素导致的，需要进行手术治疗，严重者需要给予透析治疗。
如果是慢性肾病引起的肾功能异常，临床上主要见于慢性肾小球肾炎、高血压肾损害、糖尿病肾病、肾病综合征等，需要做肾穿明确具体的病理类型。需要应用控制血压、减少尿蛋白的药物，比如ACEI或ARB类的药物。
还需要应用百令胶囊保护肾脏以及降低肌酐的药物，比如尿毒清颗粒等，需要控制好血糖、血脂。需要根据病理结果，应用激素以及免疫抑制剂的药物进行治疗。