肌肉萎缩有些情况下是完全能够恢复正常的，有些情况下可以得到一定程度的改善和缓解，有些情况下是不能够恢复的。
比如，肌肉萎缩是由于废用性原因导致的，经过相应的肌肉按摩、物理治疗以及功能康复训练，逐渐地可以完全恢复正常。有些肌肉萎缩会出现肌肉结构的改变，或者支配肌肉的神经产生了不可逆的损害，即使经过相应的治疗，肌肉萎缩也不可能恢复到完全正常的水平，但是肌肉力量和功能可以得到一定的改善。
有些情况下肌肉会出现相应的纤维化、变性、挛缩，完全失去了正常的肌肉组织结构。这种情况下想要进行恢复几乎是非常困难的，常常需要对局部采取肌腱，或者肌肉的转位来恢复局部的功能。