导致房间隔缺损最主要的原因就是由于基因突变，导致的胎儿出现心脏缺陷。
最常见的就是由于染色体畸形或者是单基因、多基因、遗传缺陷，都可能会导致房间隔缺损。还有一些诱发的因素，比如母亲在怀孕的早期时，出现风疹病毒或者是流感等情况，容易导致胎儿出现房间隔缺损。也有可能是由于孕期接受放射线或者是夫妻双方都吸烟，吃了一些药物所导致。
所以房间隔缺损的患儿，一定要做到早发现、早治疗。主要就是应用手术的治疗方法，改善患儿的临床症状；同时，也要加强患儿的护理工作，一定要注意保暖，避免感冒和感染。