先天性巨结肠和早产是没有直接关系。
早产的孩子和足月的孩子，都可能患先天性巨结肠，不论是早产还是足月的孩子，先天性巨结肠的治疗都是一样，需要根据病变肠管的长短、严重程度以及孩子的症状来决定。如果孩子在新生儿期就出现明显腹胀、顽固性便秘，则需要考虑先行肠道造瘘手术。如果孩子在新生儿期可以通过一般的辅助方法通便，使肚子不是非常胀，可以等到6个月左右的时候，行巨结肠根治术。
新生儿如果想做手术时，一般孩子体重大于3千克，全身情况良好，可行巨结肠根治术。