急性扁桃体炎和慢性扁桃体炎的差别主要表现在病程持续时间以及临床症状方面。急性扁桃体炎一般发病较急，短时间内会出现明显的红肿疼痛症状，经过积极治疗考虑一周左右病情可以好转。
慢性扁桃体炎是由急性扁桃体炎没有完全治愈导致的，一般慢性扁桃体多会出现长期肿大表现，患者可能长时间会感觉喉咙不舒服，或者出现打呼噜等一些临床症状，慢性扁桃体炎的病程较长甚至会达到几年之久。
另外当患者免疫力下降时，慢性扁桃体炎可以出现急性发作情况。临床上对于急性扁桃体炎，多建议使用足量抗生素进行治疗；而慢性扁桃体炎建议中医调理，必要时需要进行手术治疗。