肛周脓肿需要进行手术，目前在临床上也多是采用一次性的根治手术。成年人的肛周脓肿想要彻底的治愈，一般都得通过手术进行治疗。
如果已经有脓液的形成，患者自身的手术时机尚不成熟，因为工作学习繁忙，而没有时间做手术的情况下，可以先进行切开引流的手术。也就是在脓肿波动感最明显的位置进行切开，然后将脓液排出，可以缓解患者的疼痛，另外也可以有效地避免脓肿进一步的发展。
肛周脓肿属于肛门周围感染化脓性的疾病，单纯地通过抗生素药物的保守治疗，达不到根治的作用，只是临时性的缓解疼痛，所以肛周脓肿在诊断明确以后，还是推荐进行手术的治疗。