通过一些必要的实验室检查，即使没有症状，但是检查结果呈阳性，也可以确诊为非淋菌性尿道炎。
首先非淋菌性尿道炎的早期症状并不明显，患者可能只是偶尔出现尿频、尿痛、尿道外口少量的无色稀薄分泌物等尿路感染表现，很容易被患者忽视，但是随着病情的进展，尿道炎的症状会逐渐的增多、加重，该类疾病的潜伏期大约在2-3周。
其次对于没有症状的非淋菌性尿道炎患者，可以应用尿常规、尿道分泌物检查、尿液细菌培养检查来判断是否存在非淋菌性尿道炎。